Кандидат економічних наук.
Петрушенко Юрій Миколайович є випускником економічного факультету Сумського державного університету. Спеціальність «Фінанси». У 2003 році закінчив аспірантуру Харківського національного університету ім. В. Н. Каразіна. Кандидат економічних наук (2004), доцент (2006). У 2013 році закінчив докторантуру Сумського державного університету.
Автор понад 100 наукових та науково-методичних праць, серед яких навчальні посібники, колективні монографії, численні статті з проблем теорії та практики забезпечення соціально-економічного розвитку територіальних громад.
Учасник 30 міжнародних наукових конференцій (у тому числі в Латвії, Польщі, Литві, Російській Федерації, Німеччині, Чехії).
Отримував гранти на проведення наукових досліджень від таких міжнародних організацій, як National Council of Economic Education (USA), Center for Advanced Studies and Education (CASE Lithuania), The Economics Education and Research Consortium (EERS), United Nations Development Programme (UNDP Ukraine).
Стипендіат Кабінету міністрів України для молодих учених (2011).
Проходив стажування в наукових закладах та громадських інституціях Шотландії, Польщі, Литви та Данії. З 2012 року – координатор мережі ВНЗ, що є партнерами міжнародного проекту Європейського Союзу та Програми розвитку ООН «Місцевий розвиток, орієнтований на громаду».
Наукові інтереси: громадські фінанси, управління місцевим розвитком, економічна теорія соціальних комунікацій.